Las instalaciones de investigación en el Laboratorio de Achotines incluyen tanques circulares de hormigón para peces reproductores, uno de 1300 m³, dos de 170 m³, y tres de 85 m³, bajo cubierta en un edificio de 1300 m² sin paredes.  Otros edificios contienen instalaciones para incubar huevos, criar larvas y juveniles, y la producción de algas y rotíferos para alimentar a los peces, una biblioteca, un laboratorio analítico, y un laboratorio de ADN.  Hay también alojamiento para los investigadores, un taller, y un muelle en la bahía para atracar los barcos. Gran parte de los edificios y equipo instalados como parte del proyecto conjunto devinieron propiedad del Gobierno de Panamá al concluir el proyecto en 2001.  En 2002 se acordó que permanecerían en el Laboratorio para uso por el personal de la CIAT en sus investigaciones.